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2003年11月3日，滄州市公安局刑警支隊對新華公安分局刑警大隊送檢的血樣進行化驗，先確定楊新海血型為"B"型，正與皖、豫、魯、冀系列殺人、搶劫、強姦案犯罪分子是同一血型，這無疑又使偵破向前跨進一大步。
這個消息立即報告到滄州市公安局局長張峰那裡。張峰向市局刑警支隊支隊長董金生指示：為了作出更準確的判斷，連夜派人將血樣送到省公安廳做ＤＮＡ檢驗。隨後，張峰親自來到新華公安分局刑警大隊審訊室，叮囑審訊人員：要對嫌疑人嚴加看管，保證做到萬無一失。新華公安分局的刑警隨即把楊新海銬在一張很堅固的審訊椅子上，用4副手銬分別銬住他的手腳。而此時的楊新海仍然僥倖地認為：滄州的公安機關沒有掌握住他作案的任何證據，不久就會放他走人。他以前不是曾經蹲過鐵籠子嗎？蹲不了半天就放出來了。
當天，滄州市公安局刑警支隊和新華公安分局刑警大隊連夜把楊新海的血樣送到300公里外的石家莊，對楊新海進行DNA檢驗。河北省公安廳很快通過DNA技術鑑定：楊新海的DNA和多起殺人大案犯罪嫌疑人所留在現場的毛髮等遺物的DNA圖譜相同度為999999％。11月5日，河北省公安廳確定：這個自稱叫楊新海的人就是皖、豫、魯、冀系列殺人、搶劫、強姦案的犯罪嫌疑人。
公安部督辦的1號系列殺人案嫌疑人楊新海在滄州落網的消息很快傳開了。當刑警們前去滄州市供銷賓館對楊新海住過的205房間進行依法搜查時，正在值班的女服務員已經聽說楊新海被抓前就住在這家賓館，她說："太可怕了！雖然那天不是我給他登記的，但一想起他殺了那麼多人我就害怕，我一連兩個晚上沒睡好。"
楊新海住過的房間被公安部門查封，房間鑰匙也被帶走。
公安機關與楊新海的激烈交鋒還在後面。
皖、豫、魯、冀系列殺人、搶劫、強姦案件在滄州取得實質性的進展後，河北省公安廳十分重視，立即成立審訊工作指揮部。2003年11月5日上午，河北省公安廳刑偵局局長魏晉虎、副局長陳國平帶領有關人員，從石家莊趕到滄州。為迅速攻克此案，指揮部專門研究制定了對楊新海進行訊問的工作方案，並從各地抽調有訊問特長的13名警官組成3個訊問小組。
11月5日15時，楊新海被從新華公安分局刑警大隊審訊室帶了出來，公安人員為他戴上專用頭套，押上了一輛封閉式的警車，楊新海猜不出這是將他帶到哪裡去，但他仍在想：這是要放我，還是轉移羈押地點？
15時30分，在滄州市公安局刑警支隊大院裡，18名著裝整齊的民警列成兩排，6名武警戰士筆直站立，透出一種莊嚴與威懾。這時，3輛警車魚貫而入，身高只有160米的楊新海，被兩名武警戰士押了出來。當罩在他頭上的專用頭套被摘掉時，他被突然出現在眼前的威嚴氣勢所驚怵，他的雙腿一下子軟了下去，幾乎是被武警戰士架著進入訊問室的。
楊新海是一個對自己的外在形象十分看重的人，他一遍遍地整理衣服，衣扣一定要端正，衣角一定要平整。儘管平時他大都睡在公園裡、車站前，但衣服稍微一髒，就去住旅店，這樣做的目的只有一個：洗洗衣服。楊新海被鎖進審訊椅之後，很認真地系好衣扣、拽平皺褶、撣去灰塵。
審訊室里很靜。楊新海抬起頭時，幾雙威嚴的目光正盯著他，他感到氣氛緊張，心裡發毛。
"楊新海！"一個雄渾的聲音在喊他，這個多次進宮的慣犯習慣性地答應了一聲："有。"
"你知道為什麼把你帶到這裡來嗎？"
"不知道。"
審訊人員斬釘截鐵地說："你犯下了侵害人民生命財產的滔天大罪！"
楊新海的大腦"轟"地一下子就炸開了，他心裡暗暗地叫道：完了，我的末日到了！但他不知道這些公安人員到底能掌握他的多少犯罪證據，他還在作著軟弱無力地頑抗："我不知道你說的是什麼意思。"
"你知道發生在皖、豫、魯、冀4省的系列殺人案嗎？"
"不知道。"
這時，審訊人員適時出示了河北省公安廳的DNA鑑定書，說："經對犯罪嫌疑人遺落在現場的毛髮進行DNA鑑定，與你血液中的DNA鑑定相比對，兩者的DNA相同度為999999％。"
此時，楊新海才明白了，原來11月3日抽他的血是為了做DNA鑑定的。他知道，科學技術已認定他是犯罪嫌疑人，有證據在，抵賴完全是徒勞，他也知道自己的罪惡有多大，警察這次是不會放過他的了。他後悔當初作案時沒有把所有的毛髮都剃光，不然他們就沒有做DNA鑑定的條件了。但他還不肯束手就範："我知道ＤＮＡ是科學，他的準確率不就是99％嗎，我就是那1％！"
審訊人員拍案而起："楊新海！你在安徽、河南、山東、河北作下了多起滅門慘案，現在證據確鑿，你還不肯交代罪行嗎？"
楊新海不敢正視那威嚴的目光，他小眼珠轉了轉說："我是作過幾起案，但我知道，也不能每個現場都留有毛髮。有證據的，我就認，沒有證據，你們也別嚇唬我。你們總不能把全國的案子都往我頭上推。"
"你先說說，哪些起案件是你作的？"