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自朱怡成從寧波出兵到最終拿下蘇州，前後經歷兩個半月，不僅地盤擴大了一倍還多，而且還拿下了南京、杭州、蘇州這樣的大城，更控制住了長江口至南京到太平府（今馬鞍山）一帶的水路。
由於明軍大勝，導致長江中上游的清軍壓力頓時大增，正對袁奇部進行攻擊的清軍為防明軍水師沿江而上直抵九江，從而兩部匯合，清軍不得不減弱的攻勢，針對明軍水師可能攻擊的區域進行布防。
同時在江北，因為明軍占領南京後清軍更怕明軍直接渡江趁勝北擊，不得不把在河南的大軍向江北調動，聯同山東綠營從通州（南通）——泰州——揚州——滁州一線布置江防。
如此一來，袁奇和祝建才兩部壓力頓時大減，逐漸穩住陣腳，同清軍形成了僵持狀態。
占據了江南、浙江和台灣三地後，明軍的攻勢也緩了下來。說實話，雖此戰收穫大大超出了預期，使得朱怡成勢力大增，但拿下這麼多地盤不免也有些「消化不良」。
如今，朱怡成的總兵力已超過了十萬，可這十多萬人要控制如此大的區域還是比較困難的，除了比如南京、杭州、寧波、蘇州、松江、台州、溫州、麗水等這些重要城市有重兵駐紮外，其餘各小州縣的控制力並不強，再加上此次戰役共俘虜清軍（含團練兵勇）五萬多人，另有三萬多的地方義軍需要整編，再加上所占各城市的實際控制也需要人手和時間去處置，所以當得知藍理和年羹堯主動撤軍後，朱怡成只是下令繼續就地駐防，並未讓部隊向福建進行攻擊。
「恭喜監國！」回到南京不久，鄔思道帶著六部人員總算趕到了南京，一見朱怡成後鄔思道就笑著行禮恭賀。
「鄔先生你可來了，你如果再不來孤得焦頭爛額了。」見到鄔思道，朱怡成是欣喜萬分，仗打完了，可接下來要處理的事是千頭萬緒，雖然有廖煥之進行協助，但這一次拿下的地盤實在是太大了，另外還有之前說的俘虜和義軍整編工作，再加上其他各項事務，朱怡成這幾日是忙得連吃飯時間都沒有。
聽完朱怡成述苦，鄔思道頓時大笑起來，胸有成竹地告訴朱怡成，他來之前已做了計劃，等把計劃細細向朱怡成講解後，朱怡成頓時大喜，馬上把同樣焦頭爛額的廖煥之找來，讓他們兩人儘快安置這些政務。
「監國，政務之事先不急，不過現在有三件事需儘快安排，不知監國您是否有所考慮？」喊人去找廖煥之的時候，鄔思道神色凝重地對朱怡成問。
「三件事？還請先生賜教。」
「其一，封賞眾臣！」鄔思道講道：「此戰我大明已動搖滿清國本，尤其是南京應天府收復後，天下為之震動！監國為大明之主，當封賞眾臣，並大赦以安民心，同時此舉更能令天下歸心於監國。」
「此事孤已考慮了，正等先生來後再辦。」朱怡成笑道。
鄔思道滿意地點點頭，繼續道：「其二，請監國儘快開科舉，納賢士，布告天下！」
鄔思道此言一出，朱怡成倒是一愣，對於科舉什麼他從來沒有這個考慮，這也是他的後世教育思維所致，畢竟朱怡成不是這個時代的人，對於科舉的重要性也不是很清楚，再加上之前在寧波只是一地方義軍勢力，也未有搞科舉的資格，就算那時候宣布開科舉在天下人眼裡恐怕也就是個笑話，那怕他後來在寧波重登監國之位也是如此，地盤僅不到半省之地，四周都是強敵，何談科舉一事？
但如今不同了，拿下江南、浙江再加台灣，擁兵十多萬，此時此刻朱怡成已完全有了和清廷叫板的資本，而當初那些觀望，認為朱怡成只不過是一個朝不保夕的反賊的士紳和讀書人如今也漸漸改變了態度。其他的不說，僅當南京拿下後，周邊幾個小城根本就是大軍到後城開，許多地方官員甚至主動投降。這樣的情況在義軍剛剛起兵時是根本看不到的，這足以表明人心已隨著朱怡成的勢力龐大而產生了變化。
這些，雖然朱怡成已朦朧感覺到，卻並沒有細想過，而現在鄔思道一言點破頓時讓他恍然大悟。沒錯，此時正是開科舉的大好機會，只要科舉一開，手上人才缺乏的情況必然大大緩解，更重要的是他可以藉此把地方鄉紳和大多數讀書人全部拉進大明的陣營，這對於穩妥統治，安撫地方也是有極大好處的。
「先生一言點醒夢中人，孤謝過先生！」朱怡成起身鄭重其事地向鄔思道行禮道謝，鄔思道腿腳不便來不及阻攔，只能勉強側開身子以示不敢受禮。但從他滿意的笑容來看，對於朱怡成如此能納其言並且尊重自己的作風大為欣賞。
「不知先生所說的第三件事是為何？」同鄔思道商議了下如此開科舉的細節後，朱怡成問道。
「監國對目前局勢如何看？」鄔思道並未馬上說第三件事，而是問起了現在局勢。
這局勢是擺在面前的，拿下江南，再加長江天險，朱怡成其大勢基本已成，而清軍雖然依舊強大，但在短時間內對於明軍已無法作出大規模的軍事行動。依朱怡成看來，清軍暫時對明軍主要會採取防禦措施，同時從其他地方調集兵力先解決掉袁奇和祝建才部，等這兩部被滅後，清軍就再無內患之憂，就能集中力量掉頭對付明軍。
至於明軍，也需要一定的時間消化現在的勝利果實，積蓄力量以備下一次戰略。同時，明軍也不能坐視袁奇和祝建才兩部被滅，拿下南京後明軍已占有長江之利，隨時可沿江而上支援袁、祝二部，同時給予清軍壓力。