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但途中遭遇到了襲擊。
阿爾伯特·威斯克派出小隊調查，在發現火車乘客都感染了生化病毒後，便下令讓手下啟動列車，讓其撞毀……
這也是為什麼。
列車忽然啟動。
但是。
阿爾伯特·威斯克的手下，還沒讓列車撞毀，就死在了水蛭群的襲擊下。
而主角瑞貝卡，此時也趕到了列車頭。
而他們的首要目的，當然是讓列車停下來。
不然就要落得車毀人亡的結局了。
這裡。
電影借鑑了遊戲中的關卡設計，瑞貝卡想讓火車停下來，必須要尋找剎車機關。
期間還要面對喪屍的撲擊。
緊張感拉滿。
一副快要結局的模樣。
不過好在。
在千鈞一髮之際，瑞貝卡終於是完成了自己的工作。
最終。
在列車車毀人亡的最後一刻。
伴隨著巨大的轟鳴，停了下來了。
而主角兩人安然無恙。
但是。
故事還遠沒有結束……
列車停下了。
兩人卻來到了一個陌生的地方。
他們穿過惡臭的下水道。
走進了真正噩夢發生的地方。
整個生化危機的開端。
保護傘公司的……幹部培訓所！
……
影院裡。
騎星澤和鍾尹最終……還是沒走。
不過。
他們看到列車停下。
真的以為，電影結束了。
但一看時間，才發現，電影僅僅過去了四十分鐘而已。
只能說。
看得太入迷了。
而接下來的劇情。
這才正式揭曉了，水蛭和病毒的起源。
這座古老的保護傘公司幹部培訓所，是保護傘公司的訓練設施。
本來是為保護傘公司訓練幹部的。
在那裡，兩位主角，找到了詹姆斯·馬庫斯的相關資料。
他是訓練設施的負責人，同時也是發現始祖病毒的人，還是保護傘公司的創始人之一。
馬庫斯潛心進行始祖病毒的研究，並將病毒與水蛭DNA結合，最終開發了以造就生物兵器為目的的『T病毒』，在保護傘公司內樹立了極高的威信。
不過，隨著研究的進展，馬庫斯的人格也慢慢產生了扭曲，他已不滿足僅僅以動物進行試驗，而是將目光瞄準了人類……甚至拿公司的研究員幹部來做實驗。
保護傘公司的另外一個高層，害怕馬庫斯如果繼續進行研究的話，會威脅到自己的地位，便派威廉和威斯克暗殺了馬庫斯。
然而，被射殺，扔到下水道中的馬庫斯由於水蛭女王病毒的作用並未死去，而是在不為人知的情況用十年的時間死而復生，成為了一個與水蛭結合的生命體。
而列車出事。
正是馬庫斯利用體內的病毒，和召喚水蛭的能力，報復保護傘公司導致的。
這就是一切慘劇的起因。
這便是傘公司幾乎無人知曉的隱秘往事。
同時。
這也是一切生化病毒的起源。
後面，生化危機會出現越來越變態的病毒。
但這一切，都跟馬庫斯的『T病毒』有關。
馬庫斯死而復生，現在，他想要憑藉自己的力量奪取世界。
但兩個年輕人——瑞貝卡、比利卻讓他的野心化作泡影。
兩人闖入幹部培訓所。
他們經過調查，了解真相後，一頓彈藥傾瀉後，戰勝了馬庫斯化身的水蛭女王。
然後。
面對再度異化的水蛭女王。
一個負責吸引注意力。
一個則負責開啟天窗，讓陽光照射在生於陰暗潮濕處，害怕紫外線的水蛭身上。
徹底消滅對方。
他們成功了。
將《生化危機》電影中的水蛭女王，送去見上帝。
而最後。
伴隨著訓練設施自爆。
保護傘公司幹部培訓所化作爆炸火光，沖天而起。
一切都結束了。
瑞貝卡、比利兩人迎著陽光，死裡逃生。
最後。
兩人告別。
瑞貝卡扯掉比利脖子上的狗牌，戴在了自己的脖子上，象徵著她認可了這個男人。
接著。
互相敬禮。
電影也在這裡。
迎來了結束。
瑞貝卡背對著陽光，率先離去。
比利則目送對方離開後，轉頭朝另一個方向走去。
影院，雖然還有觀眾沒反應過來，但大部分人都準備離開了。
但就在這時。
鏡頭往前拉。
緩緩給到了剛剛兩位主角站立的懸崖下方。
懸崖下方。
霧色瀰漫的森林中。
一座風格華麗的洋館靜靜屹立著……
接著。
電影戛然而止。
……
騎星澤和鍾尹都半站起來了。
卻突然看到了屏幕上，出現了一座風格華麗的洋館。
不過還沒等他們重新坐下。
電影就黑屏了。
兩人只能繼續起身，轉身離開電影院。
一邊走，一邊聊。
「這……故事還沒結束啊？」鍾尹有些好奇問道。