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郭藥師任職同知燕山府期間，自恃徽宗恩寵有加，為所欲為，飛揚跋扈。
而知府王安中
「不能制，第曲意奉之」。[12]凡是郭藥師所要的兵械甲杖馬匹，朝廷都儘量供給。
他派部下到宋境內的各州做生意，賺取錢財。又召集天祚帝的工匠製造各種珍奇之物結交權貴。
這時常勝軍已有5萬之眾，而鄉兵號稱30萬。但郭藥師及其部下都不改
「左衽」，即仍穿遼服，而不著宋裝。當時人將其與安祿山相比。郭藥師雖然難以羈致，但也為宋立下了一些戰功。
燕京被金兵攻破後，蕭干自號大奚國神聖皇帝，改元天阜。宋宣和五年（1123）六月，蕭干因缺糧率兵出盧龍嶺，攻破景州。
又敗常勝軍張令徽、劉舜仁部於石門鎮，攻陷薊州。當時形勢十分危急，童貫從京師移文嚴厲斥責王安中和郭藥師。
七月，郭藥師與蕭干戰於腰鋪，大敗蕭干，乘勝追擊過盧龍嶺，殺傷過半。
蕭干為其部下白得歌所殺，首級被獻於宋。八月，郭藥師又敗蕭幹部下夔離不於峰山，生擒阿魯太師，得遼太宗耶律德光的尊號寶檢及塗金印，解除了遼殘餘勢力對宋的威脅。
宋金的
「海上之盟」只是基於夾攻遼的短暫同盟，一旦遼亡，宋金直接交界，戰爭也就不可避免。
金天會三年（1125，宋宣和七年）十一月，金兵分東西兩路攻宋，東路軍以宗望（斡離不）為南京路都統，自南京入燕山，連陷檀、薊州。
郭藥師率常勝軍在白河與金軍相遇。
「藥師之兵戈甲鮮明，步伍整肅，金人初見亦懼。斡離不乃東向望日而拜，號令諸部而進。藥師鏖戰三十餘里，金人已北，張令徽等先自遁，金人力追之」。
[13]張令徽等的逃跑，導致常勝軍的全面潰敗，而燕京也就守不住了。
郭藥師與宋知燕山府蔡靖商議投降，蔡靖不願，於是郭藥師扣押了蔡靖及轉運使呂頤浩等，向宗望投降。
金兵入燕京。消息傳到宋廷之後，
「帝猶密其事，議封為燕王割地與之，使世守，而已無及」。[14]在當時紛亂的局勢中，郭藥師不顧宋對他的浩蕩之恩，而又一次選擇了變，由宋之
「厲階」而成為金之
「功臣」。金之功臣郭藥師降金後，
「太宗以藥師為燕京留守，給以金牌，賜姓完顏氏。從宗望伐宋，凡宋事虛實，藥師盡知之」。
[14]由於郭藥師對宋情況的了解，因此宗望由燕京南下攻宋，令郭藥師率1000騎兵為先鋒。
藥師辭以兵少，金人又給其1000騎兵，並且命令他所過州縣不得擅自誅殺。
後徽宗禪位於欽宗的消息傳到了宗望營中，宗望惟恐宋朝有所準備而想退師。
「郭藥師曰南朝未必有備，言汴京富庶及宮禁中事非燕山之比，令太子郎君兵行神速，可乘此破竹之勢，急趨大河，將士必破勝，可不戰而還。苟聞有備，耀兵河北，虎視南朝，以示國威，歸之未晚」。
[15]這樣，宗望聽從了他的建議，而長驅直下。金天會四年正月七日，宗望所部到達汴京，由郭藥師引導，駐於城西北的牟駝崗。
此前，郭藥師曾在牟駝崗打過球，知道宋的天駟監在此有馬二萬匹，飼料山積，於是引導宗望盡取之。
金兵攻汴京不能下，與宋議和，金
「詰索宮省與邀取寶器服玩，皆藥師導之也」。[16]這樣，郭藥師為金立下了汗馬功勞。
但金退兵後，宗望卻找藉口奪取了郭藥師的常勝軍。其後郭藥師的經歷，《宋史》、《金史》本傳都未記載，在《大金國志》、《建炎以來系年要錄》等書中可找到蛛絲馬跡。
金天會十年（1132）秋，時為平州守的郭藥師不知因何原因下元帥府獄，不久獲釋，但其家產盡為左副元帥完顏宗翰所得。
對此，《大金國志》作者有一段評論十分恰當：「大金雖以權宜用之，其心豈不疑之哉？始奪其常勝軍並器甲鞍馬散之，繼奪其家財沒入之，藥師得不死幸矣。」[17]從此，郭藥師就不見載於史籍了。
《金史》稱：郭藥師，渤海鐵州人也。遼國募遼東人為兵，使報怨於女直，號曰
「怨軍」，藥師為其渠帥。斡魯古攻顯州，敗藥師於城下。遼帝亡保天德，耶律捏里自立，改
「怨軍」為
「常勝軍」，擢藥師諸衛上將軍。捏里死，其妻蕭妃稱制，藥師以涿、易二州歸於宋。
藥師以宋兵六千人奄至燕京，甄五臣以五千人奪迎春門，皆入城。蕭妃令閉城門與宋兵巷戰。
藥師大敗，失馬步走，逾城以免。宋人猶厚賞之。金史太祖割燕山六州與宋人，宋使藥師副王安中守燕山。
及安中不能庇張覺而殺之，函其首以與宗望，藥師深尤宋人，而無自固之志矣。
宗望軍至三河，藥師等拒戰於白河。兵敗，藥師乃降。宗望遂取燕山。
太宗以藥師為燕京留守，給以金牌，賜姓完顏氏。從宗望伐宋，凡宋事虛實，藥師盡知之。
宗望能以懸軍深入，駐兵汴城下，約質納幣，割地全勝以歸者，藥師能測宋人之情，中其肯綮故也。
及兩鎮不受約束，命諸將討之，藥師破順安軍營，殺三千餘人。海陵即位，詔賜諸姓者皆複本姓，故藥師子安國仍姓郭氏。