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就這樣，在整個基地內保持最高警戒狀態中，與碇源堂的通訊終於接通，而當葛城美里將羅傑是使徒，以及她嘗試接觸，對方說的一部分話語等等告之之後，碇源堂維持了至少五分鐘左右的沉默狀態，這才下達了暫時觀察，不必攻擊的命令。
葛城美里自然不傻，一些對話她並沒有說出來，她知道，一旦高層知道她知曉了這些事情，那麼等待她的下場絕對不會好到那裡去，或許某一天她就直接消失了，但是什麼都不說也不可能，畢竟將對方判定為使徒，而且親自前往，這是許多人都看到的事情，她無法抵賴，但是全部說出來也絕對不可能……想到這裡，葛城美里真覺得恨死了那個名為阿星的聖徒，為什麼要讓她知道這一切……
葛城美里是一個極擅隱藏的人，雖然對外表現得有些大咧咧的，而且還喜歡把話說到明處，但其實她比任何人都懂得藏拙，而且從很早以前就開始調查Nerv的各種信息，使徒的各種信息，以及各國與SEELE的關係，事實上，她還聯絡了一批有能力與力量的人，在各種情況下她都有預備計劃，但是誰知道卻突然出現了一個人形的使徒，而且還告訴了她這麼多的內幕……
該相信嗎……不，應該是，該怎麼去做，碇源堂如此的反應，證明這其中肯定有著黑深的內幕……
之後，葛城美里通過她的秘密渠道，與抵達新東京的加持良治取得了聯繫，然後從這個掌握了許多秘密的男人那裡隱約得到了確認，關於第二把槍，卡西烏斯的存在……
「海洋生物生態保護研究所？」
碇真嗣結束了今天的EVA例行駕駛測試，他正欣喜的發現，自己的同步率居然大幅度提升了，已經超過了明日香百分之十還多時，之前他認識的，據說是美里小姐的前男友，名為加持良治的大叔給他打了招呼，然後邀請他前往所謂的海洋生物生態保護研究所去參觀。
其實一開始碇真嗣是拒絕的，總不能你讓我去，我就立刻就去，不過當他聽說也會邀請明日香與凌波麗，還有他的兩個死黨同學，以及羅傑大叔時，他終於沒忍住誘惑答應了下來，因為他最重要的人基本上都被邀請了，雖然他嘴上沒說，但是心裡卻是十分開心的，特別是最近和凌波麗有了話說，而且似乎和明日香的關係也開始變好……
總的來說，最近，似乎是遇到羅傑大叔之後，似乎一切都開始變好，朋友，同事，甚至是家人，據美里小姐所說，當父親知道他同步率又一次提升之後，那怕人在月球，也誇獎了他，說他做得很好，這讓他非常開心，這種一步一步小小的努力，然後匯聚成最後的成果的感覺……真的非常好，這也讓他心裡萌發了些許的希望，是不是自己再努力一些，努力和朋友們結交，努力和父親交流，最後這個世界……會對他更友善一些呢？
正是開始抱著這樣的想法，第一次的，碇真嗣開始主動去聯絡那些被邀請的人，明日香已經知曉了，而凌波麗似乎因為某些原因而長時間沒有去學校，就必須由他親自去通知，然後還有兩個死黨同學，然後就是羅傑大叔了，希望大叔也喜歡海洋生物。
然後在第三天，也就是被邀請的那一天，除了凌波麗姍姍來遲以外，其餘人都已經來到了目的地，事實上，這個地方是政府專有的警戒區域，在研究所外圍甚至還有軍隊把守，雖然完全無法與Nerv基地相比，但是也算是重兵把守區域了，若不是加持良治邀請帶隊，這裡基本上沒人可以進得來……普通情況而論。
不過出乎所有人預料的是，被邀請的羅傑以外，另外還有一個人跟隨羅傑而來，就是之前與葛城美里對話的阿星，事實上，在與葛城美里對話之後，阿星也分析了一下接下來的各種情況，其中最大可能就是加持良治將會邀請羅傑去參觀那個海洋生物保護的研究所。
而這其實又分為了兩種情況，一種是葛城美里與加持良治私下裡沒有情報溝通，因為在EVA原劇情中，無論是原本TV版，還是後面的新劇場版，加持良治都是一個身份神秘的間諜，而且很可能是雙重，多重間諜，他的幕後所屬不明，既有些像是SEELE組織的，又像是各個國家的，甚至可能是另外神秘組織的間諜，總之他非常神秘，而第一種情況就是加持良治並沒有從葛城美里那裡知道，羅傑是使徒的事實，但是因為羅傑本身就來歷莫名，所以才會邀請羅傑一同前來，然後尋找羅傑存在的蛛絲馬跡。
至於第二種情況，則是葛城美里與加持良治有聯繫，不是指他們兩個人明面上的情侶關係，而是暗地裡對於信息情報交流的同事關係，若是如此，那麼加持良治就知道了羅傑的使徒身份，那麼這次邀請羅傑前來，就絕對不單單只是試探罷了。
無論是哪一種情況，阿星都不認為羅傑可以處理得好，在他認為中，最可能出現的情況是羅傑被詢問到之後，就大咧咧承認自己不是使徒，或者直接答非所問，讓人知道他是個白痴的事實，無論是任何情況，都會讓阿星的布局完全被顛覆，所以阿星不得不跟隨前來，況且他也對加持良治很有興趣，想和加持良治取得聯繫，之後的布局很可能需要藉助他的力量。
就這樣，雖然阿星是在邀請規格之外的人，但是在加持良治跟隨的情況下，他還是隨同眾人一起進入到了研究所中，之後就是十多道程序限定，各種殺毒殺菌除塵什麼的之後，眾人才進入到了研究所真正的核心區域，在那裡就有大量的海洋生物存在，從最大的鯨魚，到最小的水母，日本海附近的生物幾乎是應有盡有。