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如果沒有外部勢力干涉，兩股真明獨立軍都註定難成氣候。
朱祁鎮和朱厚照兩次成功逃亡之後，黃世龍異常憤怒，聯合風念羲妖國進一步收緊對朱明龍氣眷顧者的監管。凡是不肯乖乖配合兩大妖國的眷顧者，立刻就地斬殺;即使眷顧者願意妥協稱臣，稍不如意，也是死罪。這些殘暴政策，導致朱明眷顧者名單是有史以來變化最快的名單，朱明國運眷顧者也是有史以來最悲慘的眷顧者，幾乎沒有眷顧者能夠順利活到一百歲。
哪裡有壓迫，哪裡就有反抗。
朱明國運眷顧者憎恨人形妖族的殘暴統治，相繼投入人類獨立軍陣營，孤注一擲與智慧妖族作鬥爭。例如名將戚繼光，他被風念羲妖國殺害之後，就有餘部以戚繼光舊部名號在江南遊擊戰鬥。
等等。
鏡頭回到花園郡，藏在花園郡的人類獨立軍，堅持朱祁鎮為正統。除非發誓效忠已經逝世的朱祁鎮陛下，否則任你斬殺多少妖兵妖將、立下多少汗馬功勞，也不被他們認可。魏東生無意效忠已經死去的朱祁鎮，也無意培養不受絕聖門聯盟制約的人類獨立軍，所以果斷熄滅與真明等人類獨立軍進一步接觸的想法。
各家人類獨立軍不適合結盟，卻可以利用。為了避免再次發生大滅絕悲劇，絕聖門需要小心謹慎刺探妖族陣營的底蘊，這些各自為政的獨立軍或可成為絕聖門聯盟刺探妖族陣營真正實力的棋子。
考慮數日，魏東生偽裝成幸運挖掘兩百年絕聖門聯盟時期遺蹟的勢力，資助一批人類獨立軍開始反抗黃世龍妖國和風念羲妖國。
1637年底，人類獨立軍挖掘一處“遺蹟”，旋即與隨後趕到的妖兵妖將發生衝突。魏東生以僅存級的48修為總觀全局，以絕聖門聯盟最新研發的靈殺4007型多功能單兵步槍為武器，埋伏暗處提前狙殺威脅度較高的妖兵妖將。
此處簡單介紹靈殺4007型多功能單兵步槍。
靈殺4007型多功能單兵步槍是專供40級以上長生者使用的多功能單兵步槍，它需要最少41級修為的靈氣激活引導、鎖定、藏匿等輔助功能。靈殺4007型多功能單兵步槍配備六種型號的狙殺子彈，其中一種是核聚變子彈。核聚變子彈意如其名，子彈本身就是超小型聚變核武器，通過靈氣鎖定、質能加速，核聚變子彈以超高速度打向目標，或者命中目標時引爆，或者接近目標時引爆，最終以超小型核聚變爆炸中心的高溫高能野蠻摧毀長生者的一切生機。
實戰經驗數據顯示，核聚變子彈幾乎無法傷害突破50級門檻的頂級長生者;46到50級的長生者，狙殺效率約為30%;45級及45級以下長生者，命中即死，狙殺效率可以視為百分之百。
經過長生種子體系持續回調，45級以上妖族長生者，最少光明正大行走世間的妖族長生者，現在已經寥寥無幾。無須動用太多珍貴的靈氣儲備，魏東生就能扛著靈殺4007型多功能單兵步槍狙殺無數高等級妖將，間接為人類獨立軍排除威脅。
有了偽裝成遺蹟的武器供應和魏東生暗中援助，原來不成氣候的人類獨立軍頓時迎來轉機。
遺蹟外圍的第一次衝突，真明人類獨立軍前所未有地全殲所有妖兵妖將，震驚了黃世龍妖國。而後，真明獨立軍一路向東席捲，並於次年四月攻克金城郡。鑑於黃世龍妖國的援軍陸續到位，繼續進軍變得前途莫測，真明獨立軍索性在金城郡建立明國，要求朱明龍氣應命者朱由檢與黃世龍妖國劃清界限，號召天下人類共擊妖族。
繼涼州明國之後，魏東生又在九州各地扶植五家勢力，合計反妖六國。
魏東生及兩名隊員頻率出擊，獵殺40級以下智慧妖族以百級，40級以上非人形智慧妖族四名，40級以上人形智慧妖族三名。
1611年時，已知的人形妖族，總共才228名。因為十二妖國的內部武裝衝突，常有人形妖族被迫解除人形或判處死刑，總數量每年都在緩慢減少。1637年初，人形妖族總數量已經降低到216名，每國才平均擁有18人。可以說，每名人形妖族都是妖族陣營的絕對精英。三名人形妖族的陣亡，不僅震動黃世龍妖國和風念羲妖國，其餘十大妖國也紛紛派遣觀察團探究原因。
魏東生暗中窺視十二妖國的反擊，發現十二妖國似乎已經盡力了。
十二妖國此刻的束手無策，極大概率是因為它們的的確確喪失了個體碾壓絕聖門聯盟的實力。
既然如此，第三階段的反攻或許可以提前啟動。
1640年，絕聖門聯盟正式啟動反攻地球軍事計劃。
為了避免長生種子體系突然從中作梗，絕聖門聯盟哪怕表面占有絕對優勢，也小心翼翼地向前推進。
1641年，絕聖門聯盟收復火星空間站。
地球大滅絕不久，火星空間站負責人也絕望地啟動火星大滅絕，摧毀了一切封閉式人工生態系統。或許因為重建火星永久空間站成本較高，智慧妖族放棄追求絕聖門聯盟餘部同時，也主動放棄了火星。
當時，只有部分能夠適應火星環境的非生物妖族遷徙此地。但火星顯然並非樂土，因為地球才是長生者唯一誕生地。因為智慧妖族長生者領袖的等級越來越低，火星漸漸與地球失去聯繫。殘留火星的非生物長生者，也因為各種各樣的問題越來越少，1611年絕聖門聯盟探測器重回火星時，火星的文明痕跡已經可以忽略不計。